Губернатор Томской области, президент "Томи" Сергей Жвачкин рассказал, что клуб имеет задолженность на сумму 400 млн рублей, которая осталась после вылета команды из РПЛ. В декабре руководство "Томи" заявило, что ему удалось достичь договоренности о продолжении финансирования клуба с ПАО "Газпромнефть". Планировалось, что денежные средства, которые должны были поступить в клуб в течение первой недели после праздников, позволят покрыть образовавшиеся задолженности перед футболистами и персоналом.  – Если вы знаете историю, то у футбольного клуба "Томь" накопились долги из-за того, что ушел второй спонсор и идет отвлечение финансов на погашение долга, – приводит ТАСС слова Жвачкина. – Еще долгов около 400 млн рублей. Когда их погасят, тогда тех денег, что выделяет спонсор, будет достаточно, если мы не поставим задачу выхода в премьер-лигу. В конце января "Томь" получила от спонсора - "Газпром нефти" - 400 млн рублей и в полном объеме выплатила долги по зарплатам перед игроками. По данным томских судебных приставов, долги клуба по зарплатам, договорам и налогам за несколько месяцев составляли 175 миллионов рублей. Еще одного спонсора, "Роснефть", клуб потерял в 2016 году, из-за чего был вынужден покинуть премьер-лигу с долгами на сумму более 600 млн рублей. Из-за задолженностей клуб имеет финансовые проблемы. Девять игроков покинули клуб из-за проблем с финансированием: Ян Казаев, Илья Кухарчук, Илья Кузьмичев, Сергей Зуйков, Петр Тен, Семен Фомин, Александр Клещенко, Дмитрий Тихий и Юрий Шафинский.